Capítulo 7 Matrices de transición, fecundidad y clonal

Raymond L. Tremblay

7.1 Tres tipos de matrices

Para facilitar los análisis y interpretaciones es necesario tener claro la historia de vida de la especie y las proveniencias de los parámetros de transiciones, fecundidades y clonaje, cada sub-matriz se suma para tener un modelo de una matriz poblacional. La suma de cada una de esas sub-matrices resulta en la matriz A (matA) para evaluar varios de los parámetros del crecimiento poblacional. Un ejemplo es que para calcular la supervivencia promedia y sus intervalos de confianza, se necesita la matriz de transiciones, pero para calcular la tasa de crecimiento poblacional, se necesita la matriz A.

Definiciones de las matrices

• MatU = Matriz de Transiciones
• MatF = Matriz de Fecundidad
• MatC = Matriz de Clonaje
• MatA = MatU + MatF + MatC

Relación entre matrices; Diseño: Samuel Gascoigne

7.2 MatU: Matriz de transiciones

En la matriz de transiciones, MatU se encuentra solamente la información sobre de transiciones, estasis o retroceso entre las etapas de vida. Por consecuencia todo información sobre reproducción y clonaje es excluida. Si el diseño del modelo asume tres etapas de vida, plántulas, juvenil y adultos, se incluye solamente las siguientes transiciones.

Nota que es este modelo los juveniles no pueden regresar a ser plántulas, pero los adultos pudiese regresar a ser juvenil.

library(DiagrammeR)
library(Rage)
matU <- rbind(
  c(0.1, 0.0, 0.0),
  c(0.5, 0.3, 0.05),
  c(0.001, 0.4, 0.8)
)
stages <- c("Plantulas", "Juvenil", "Adulto")
plot_life_cycle(matU, stages=stages)

7.3 MatF: Matriz de fecundidad

Si uno sigue la figura siguiente vemos que algunos de los individuos en la segunda etapa pueden producir plántulas. Por consecuencia seria probablemente más adecuado cambiar de nombre para la segunda etapa de “juvenil” a “individuos pequeños”. Debido que el concepto de juvenil pudiese ser confundido con individuos no reproductivos. Lo que se observa en el ciclo de vida es la aportaciones de plántulas es que provienen de individuos pequeños y grande.

library(DiagrammeR)
library(Rage)
matF <- rbind(
  c(0.0, 0.4, 1.8),
  c(0.0, 0.0, 0.0),
  c(0.0, 0.0, 0.0)
)
stages <- c("Plantulas", "Ind Pequeños", "Ind Grande")
plot_life_cycle(matF, stages=stages)

7.4 MatC = Matriz de clonación

Esa matriz representa la información para especies que se reproducen por clonaje. Nota que hay necesitar de definir lo que es crecimiento por clonaje. Por ejemplo un individuo de Epidendrum que crece y que tenga más tallos, no debería ser considerado clonaje, pero crecimiento del individuo. Al contrario un individuo que crece de forma que la planta madre se separa en dos o más partes donde NO comparten conexión pudiese ser considerado clonaje. Otra alternativa es que hay muchas especies de orquídeas que producen keiki, el momento que estos se separan de la madre se pueden considerar como el mismo individuo (geneticamente igual) a parte pero ecologícamente distinto.

Necesitamos fotos de orquídeas con clonaje y keiki (quien puede ayudar)

Se debería enfatizar que añadir el concepto de clonaje dentro de la matriz de transiciones resulta en estimados de parámetros diferentes, tal como el tamaño efectivo de población, Ne, en adición de evaluar otros conceptos evolutivos. En estudios evolutivos no es el individuo como tal que es la unidad de interés pero el individuo como fuente de diversidad genética, por consecuencia individuos (clones) que son genéticamente igual son evolutivamente el mismo individuos aunque estén separado físicamente. Las poblaciones organizados en clones afecta la interpretación de datos tanto en los estudios ecológico y evolutivos (Cook 1983). Cuando se estudia especies con clonación hay que diferenciar entre los que es el “ramet” y un “genet”. Los “genets” son la suma de todas las partes “los ramets” que tiene la misma genética. Los “ramet”, son las partes individuales del individuo. En orquídea se podría considerar cada seudobulbo como un ramet y la suma de todos los seudobulbo como el “genet”. Hay acercamiento para tomar en cuenta la adecuación de los “individuos” en la matriz y por consecuencia integrar el concepto de clonación en los estimados. vea: (McGraw and Caswell 1996).

Revisión RLT: Nov 26th, 2024

References

Cook, Robert E. 1983. “Clonal Plant Populations: A Knowledge of Clonal Structure Can Affect the Interpretation of Data in a Broad Range of Ecological and Evolutionary Studies.” American Scientist 71 (3): 244–53.

McGraw, James B, and Hal Caswell. 1996. “Estimation of Individual Fitness from Life-History Data.” The American Naturalist 147 (1): 47–64.