Fecha de la ultima revisión
## [1] "2024-01-24"Tópicos especial en biología: BIOL 4026
Instructor: Raymond L. Tremblay, PhD
Oficina: NL 104
Teléfono: (787) 850-9497 (dept de biología)
Coreo electrónico: raymond.tremblay_at_upr_dot_edu
Presentación de temas y discución: L y Miercoles de 1:30-2:50pm (80 mins) (NOTE: necesita traer tu laptop!)
Hora de consulta con Estudiantes:
- Lunes y Miercoles from 10:30 a 12:30pm (NL 104) - Jueves 9:00 -12:00 -
o por MSTeam “Horas de Consulta Tremblay” (Solamente si estamos
remoto).
• Artículos revisados por pares serán asignados para fomentar el método de utilizar estas herramientas en ciencias.
Objetivos generales de la clase
Al final del curso el estudiante podrá preparar datos en hojas de MS Excel o otros formato, convertir el archivo para subirlo a R. El estudiante podrá manipular múltiples funciones de Tidyverse y aplicarlos a producir gráficos. El estudiante tendrá un conocimiento suficiente desarrollado para preparar gráficos en una diversidad de alternativas, y preparar esto para publicar o presentaciones.
Al finalizar el curso el estudiante podrá:
1. Introducción a R, RStudio y la visualización de datos
2. El ambiente R
3. El ambiente de RStudio
a. Su estructura visual y opciones
4. Subir datos a RStudio
5. Los “Packages” para el exceso a funciones
6. Producir un Data Frame
7. Preparar datos en una hoja de Excel para utilizar en R
8. Las funciones de Tidyverse
- dplyr
- forcats
- lubridate
- pipes
- tibble
- purrr
- ggplot2
9. Gráficos para conteos
10. Gráficos de una variable continua o discreta
11. Introducción a facet_wrap y facet_grid
12. Gráficos con dos variables continuas
13. Gráficos de líneas, geom_line
14. Añadir una cinta alrededor de una variable continua, geom_ribbon
15. Gráficos de líneas con categorías en el eje de x
16. Líneas con error estándar
17. Gráficos estadísticos
18. Diagrama de alfombra
19. Modelos estadísticos
20. Gráficos de densidad
21. Método Likert
22. Técnicas para evaluar los supuestos subyacentes de las pruebas estadísticas
23. Como definir su propia paleta de color
24. Preparar los gráficos para publicacionesEste curso sera evaluado con los siguiente items:
| Item | Valor |
|---|---|
| Actividades en clase, pruebas cortas (± 4) | 50 pts |
| Asignaciones (± 8) | 100pts |
| Trabajo final de presentación | 40pts |
| Asistencia a clase | 10pts |
NOTE: Escala de Notas:
Las actividades: pruebas cortas, asignaciones y otro estarán ofrecido atreves del programa MSTeam (el app es gratis, y se puede usar desde su tablet o teléfono inteligente o computadora). Tendrá que registrase con un código que le estaré enviando.
Todos los trabajos se usarán la plataforma R, RStudio (ambos gratis). El estudiante necesita una computadora portátil con 8GB de memoria mínima (las tabletas no son aceptable), tanto para Windows y Mac.
El trabajo de investigación: El estudiante utilizará datos de una revista y replicará los gráficos de con las herramientas aprendidas.
En la clase las notas serán basado primeramente en la participación y algunas pruebas cortas. Su participación es esencial para el aprendizaje (y para un ambiente positivo). Aprender NO es un proceso pasivo: los estudiantes deben participar haciendo preguntas y discutir el material con su conocimiento anterior (Su bagaje de conocimiento).
En esta clase no hay exámenes pero habrá pruebas cortas.
Es obligatorio tener la camera prendida durante la prueba corta. No es permitido usar el celular, Ud. tendrá que demostrar que el celular este detrás de uds antes de comenzar el examen
Los ejercicios están enfocado en la aplicación de conceptos y métodos discutido en la clase y solución de problemas. Se hará un esfuerza de usar datos reales para demostrar como trabajar con los análisis, tablas, y gráficos en R, RStudio y RMarkdown. Típicamente, tendrán solamente una semana para hacer los ejercicios y entregarlos en formato .html.
Los trabajos cortos y pruebas cortas NO se reponen. Si falta a la clase es su responsabilidad hablar con los otros estudiantes para saber lo que se discutió en la clase. Los examen se reponen solamente por una escusa valida.
La UPR-Humacao cumple con las leyes ADA (Americans with Disabilities Act) y 51 (Servicios Educativos Integrales para Personas con Impedimentos) para garantizar igualdad en el acceso a la educación y servicios. Estudiantes con impedimentos: informe al (la) profesor(a) de cada curso sobre sus necesidades especiales y/o de acomodo razonable para el curso, en la tarjeta de información de la primera semana y visite la Oficina de Servicios para la Población con Impedimentos (SERPI) a la brevedad posible. Se mantendrá la confidencialidad.
La Universidad de Puerto Rico promueve los más altos estándares de integridad académica y científica. El Artículo 6.2 del Reglamento General de Estudiantes de la Universidad de Puerto Rico (Certificación Núm. 13, 2009-2010, de la Junta de Síndicos) establece que la deshonestidad académica incluye, pero no se limita a: acciones fraudulentas, la obtención de notas o grados académicos valiéndose de falsas o fraudulentas simulaciones, copiar total o parcialmente la labor académica de otra persona, plagiar total o parcialmente el trabajo de otra persona, copiar total o parcialmente las respuestas de otra persona a las preguntas de un examen, haciendo o consiguiendo que otro tome en su nombre cualquier prueba o examen oral o escrito, así como la ayuda o facilitación para que otra persona incurra en la referida conducta. Cualquiera de estas acciones estará sujeta a sanciones disciplinarias en conformidad con el procedimiento disciplinario establecido en el Reglamento General de Estudiantes de la UPR vigente.
Los estudiantes no PUEDEN grabar la clase por forma de video o audio sin el permiso del profesor. Algunos estudiantes con necesidades especiales pueden hablar con el profesor para pedir el permiso. La solicitud y aprobación del permiso tiene que ser por escrito (por ejemplo por email).
La Universidad de Puerto Rico prohíbe el descrimen por razón de sexo y género en todas sus modalidades, incluyendo el hostigamiento sexual. Según la Política Institucional contra el hostigamiento sexual, en la Universidad de Puerto Rico, Cert. Núm. 130 (2014-2015) de la Junta de Gobierno, si un(a) estudiante está siendo o fue afectado por conductas relacionadas a hostigamiento sexual, puede acudir ante la Oficina del Procurador Estudiantil, el Decanato de Estudiantes o el Coordinador de Cumplimiento con Título IX para una orientación o presentar una querella.
Los teléfonos mobiles serán apagado durante la clase. Si necesita una calculadora traerla al salón. El teléfono no debería esta visible durante la clase al menos que pide permiso al instructor. Recuerda que que se usara computadoras portátiles en cada sesión.