Apéndice A

Lista completa de MPP en orquídeas

En esta sección se hace una recopilación de los estudios de dinámica poblacional en orquídeas que han usado matrices de transición de estados y de edades. Se identifican algunos de los temas principales de los trabajos.

En la siguiente tabla se presentan los estudios de dinámica poblacional en orquídeas que usaron MPP y las preguntas principales que los autores intentaron responder. En la gran mayoría de los trabajos se evalúan múltiples hipótesis/ideas sobre la dinámica poblacional de las orquídeas. Para información específica sobre la metodología usada en cada estudio, se recomienda revisar los trabajos originales.

Clave de las variables:
- Riesgo: Si se evaluó el riesgo de extinción de la especie.
- Variación espacial: Si se evaluó la variación espacial de la especie.
- Variación temporal: Si se evaluó la variación temporal de la especie.
- Latencia: Si se evaluó la importancia de la latencia (dormancy) de la especie.
- Métodos de estimación de parámetros: Si se evaluaron métodos alternos de estimación de parámetros (no tradicionales).
- Historia de vida: Si se evaluó la historia de vida de la especie en un contexto evolutivo.
- Otro: Si se evaluó otra pregunta no incluida en las anteriores.
- Referencia: Referencia del estudio.

Código

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library(gt)

Género	Especies	Riesgo	Var. esp.	Var. temp.	Latencia	Est. param.	Hist. vida	Otro	Referencia
Aspasia	principissa	Si	-	Si	-	-	-	-	Zotz & Schmidt (2006)
Brassavola	cucullata	Si	Si	Si	-	-	-	IPM, Transient Dynamics, Transfer Function	Ackerman et al. (2020)
Broughtonia	cubensis	Si	Si	Si	-	-	-	Transient Dynamics	Raventós et al. (2021)
Caladenia	amoena	Si	-	-	Si	Si	Si	Selección de modelos, método para estimar latencia	Tremblay et al. (2009a) Tremblay et al. (2009b);
Caladenia	argocalla	Si	-	-	Si	Si	Si	Selección de modelos, método para estimar latencia	Tremblay et al. (2009a) Tremblay et al. (2009b)
Caladenia	clavigera	Si	-	-	Si	Si	Si	Selección de modelos, método para estimar latencia	Tremblay et al. (2009a) Tremblay et al. (2009b)
Caladenia	elegans	Si	-	-	Si	Si	Si	Selección de modelos, método para estimar latencia	Tremblay et al. (2009a) Tremblay et al. (2009b)
Caladenia	graniticola	Si	-	-	Si	Si	Si	Selección de modelos, método para estimar latencia	Tremblay et al. (2009a) Tremblay et al. (2009b)
Caladenia	macroclavia	Si	-	-	Si	Si	Si	Selección de modelos, método para estimar latencia	Tremblay et al. (2009a) Tremblay et al. (2009b)
Caladenia	oenochila	Si	-	-	Si	Si	Si	Selección de modelos, método para estimar latencia	Tremblay et al. (2009a) Tremblay et al. (2009b)
Caladenia	rosella	Si	-	-	Si	Si	Si	Selección de modelos, método para estimar latencia	Tremblay et al. (2009a) Tremblay et al. (2009b)
Caladenia	valida	Si	-	-	Si	Si	Si	Selección de modelos, método para estimar latencia	Tremblay et al. (2009a) Tremblay et al. (2009b)
Caladenia	orientalis	Si	Si	Si	Si	-	-	Interacciones abióticas	Coates & Duncan (2009)
Cephalanthera	longifolia	-	-	-	Si	Si	Si	Interacciones abióticas y bióticas	Shefferson et al. (2012)
Cleistes	divaricata var. divaricata	Si	Si	Si	Si	Si	-	-	Gregg (1991)
Cleistes	divaricata var. bifaria	Si	Si	Si	Si	Si	-	-	Gregg (1991)
Cleistes	bifaria	-	Si	-	Si	-	-	Estructura de tamaño y estado	Gregg & Kéry (2006)
Corallorhiza	trifida	Si	-	Si	Si	-	-	-	Iriondo Alegria et al. (2009)
Crepidium	acuminatum	Si	-	Si	-	-	-	Efecto de cosecha	Timsina et al. (2021)
Cypripedium	acaule	-	-	-	-	Si	-	Edad de individuos reproductivos	Cochran & Ellner (1992)
Cypripedium	calceolus	Si	Si	Si	Si	-	-	Selección de modelos	Nicolè, Brzosko & Till-Bottraud (2005)
Cypripedium	calceolus	Si	Si	Si	Si	-	-	Efecto de aislamiento	Garcı́a, Goni & Guzmán (2010)
Cypripedium	calceolus	-	-	-	-	-	-	Costo de latencia, Interacciones abióticas y bióticas	Shefferson et al. (2012)
Cypripedium	fasciculatum	Si	Si	Si	Si	-	-	Selección de modelos, Interacciones abióticas	Thorpe et al. (2011)
Cypripedium	parviflorum	-	-	-	Si	-	Si	-	Shefferson, Warren & Pulliam (2014)
Cypripedium	reginae	-	Si	-	Si	-	Si	Selección de modelos, interacciones bióticas	Kéry & Gregg (2004)
Cypripedium	lentiginosum	-	-	-	-	Si	-	Leslie matrix	Zhongjian et al. (2008)
Dactylorhiza	hatagirea	Si	Si	Si	Si	-	-	Efecto de cosecha	Chapagain et al. (2021)
Dactylorhiza	lapponica	-	Si	Si	Si	-	-	Efecto antropogénico, interacciones abióticas	Sletvold, Øien & Moen (2010); Sletvold et al. (2013)
Dendrophylax	lindenii	Si	-	Si	-	-	-	Efecto de densidad, los datos de la matriz no están disponibles	González-Hernández (2009); Raventós et al. (2015)
Epidendrum	xanthinum	Si	Si	-	-	-	-	Comparación de poblaciones	Farfán Camargo (2008)
Epipactis	atrorubens	Si	Si	Si	Si	-	-	Incorporación de variable de endogamia	Hens et al. (2017)
Epipactis	atrorubens	-	-	-	-	-	-		Jäkäläniemi et al. (2011)
Erycina	crista-galli	Si	Si	-	-	-	-	-	Mondragón, Maldonado & Aguilar-Santelises (2007)
Erycina	crista-galli	-	-	-	-	-	-	-	Maldonado Flores (2005)
Guarianthe	aurantiaca	Si	Si	-	-	-	-	Efecto de cosecha	Mondragón (2009)
Herminium	monorchis	Si	-	Si	Si	-	-	Efecto abiótico	Wells et al. (1998)
Himantoglossum	hircinum	Si	-	Si	-	-	-	Efecto abiótico: sequía	Wells et al. (1998)
Himantoglossum	hircinum	Si	-	Si	-	-	-	Modelando expansión	Carey (1998)
Himantoglossum	hircinum	Si	-	Si	Si	-	-	Efecto abiótico: Precipitación y Temp del suelo	Pfeifer & Jetschke (2006)
Isotria	medeoloides	Si	-	Si	-	-	-	Tratamiento del dosel	Dibble et al. (2019)
Jacquiniella	leucomelana	Si	-	Si	-	-	-	Metapopulation approach	Winkler, Hülber & Hietz (2009)
Jacquiniella	teretifolia	Si	-	Si	-	-	-	Metapopulation approach	Winkler, Hülber & Hietz (2009)
Laelia	autumnalis	Si	Si	Si	-	-		Efecto de cosecha	Emeterio-Lara et al. (2021)
Laelia	speciosa	Si	-	Si	-	-	-	Efecto de cosecha	Hernández-Apolinar (1992)
Lepanthes	caritensis	Si	Si	Si	-	-	-	-	Tremblay (1997)
Lepanthes	caritensis	Si	Si	Si	-	-	-	Efecto de huracanes	Crain, Tremblay & Ferguson (2019)
Lepanthes	eltoroensis	Si	Si	-	-	-	-	Tamaño efectivo de Población, Ne y largo de vida	Tremblay & Ackerman (2001)
Lepanthes	eltoroensis	Si	Si	Si	-	-	-	-	Tremblay & Hutchings (2003)
Lepanthes	eltoroensis	Si	Si	Si	Si	-	-	Nueva metodología para estimar parámetros	Tremblay et al. (2021)
Lepanthes	rubripetala	-	-	-	-	-	-	Tamaño efectivo de Población, Ne y largo de vida	Tremblay & Ackerman (2001)
Lepanthes	rubripetala	Si	Si	Si	-	-	-	Dinámica de transiciones	Tremblay, Raventos & Ackerman (2015)
Lepanthes	rupestris	-	-	-	-	-	-	Tamaño efectivo de Población, Ne y largo de vida	Tremblay & Ackerman (2001)
Lepanthes	acuminata	Si	-	-	-	-	-	Dinámica de transiciones	Raventós et al. (2018)
Lycaste	aromatica	Si	-	Si	-	-	-	Metapopulation approach	Winkler, Hülber & Hietz (2009)
Neotinea	ustulata	Si	Si	-	Si	-	Si	Método para estimar latencia	Shefferson & Tali (2007)
Oeceoclades	maculata	Si	Si	Si	-	-	-	Especie invasiva	Riverón-Giró et al. (2019)
Oncidium	poikilostalix	Si	-	-	-	-	-	Dinámica de transiciones	Raventós et al. (2018)
Orchis	purpurea	Si	-	Si	-	-	-	LTRE	Jacquemyn, Brys & Jongejans (2010)
Orchis	ustulata	Si	Si	-	-	-	-	mismo que Neotinea ustulata	Tali (2002)
Phaius	australis	Si	Si	-	-	-	-	Efecto espacial y abiótico	Simmons (2016)
Platanthera	hookeri	Si	Si	-	-	-	-	-	Reddoch & Reddoch (2007)
Platanthera	praeclara	Si	Si	Si	Si	-	-	Variación temporal	Sieg & King (1995)
Platanthera	macrophylla	Si	Si	Si	-	-	-	Incluye estado de protocormo	Cleavitt et al. (2017) Berry & Cleavitt (2021)
Platanthera	orbiculata	Si	Si	Si	-	-	-	Incluye estado de protocormo	Cleavitt et al. (2017) Berry & Cleavitt (2021)
Prasophyllum	correctum	Si		Si	Si	-	-	Efecto de fuego	Coates, Lunt & Tremblay (2006)
Pseudorchis	albida	-	-	-	-	-	-	-	Štípková (2013)
Rodriguezia	granadensis	Si	Si	Si	-	-		Efecto antropogénico, to be digitized	Ospina-Calderón et al. (2023)
Serapias	cordigera	Si	Si	Si	Si	-	-	Efecto antropogénico	Pellegrino & Bellusci (2014)
Spathoglottis	plicata	Si	Si	Si	-	-	-	Orquídea invasiva y interacciones bióticas	Falcón, Ackerman & Tremblay (2017)
Spiranthes	delitescens	Si	Si	Si	Si	-	-	Efecto abiótico: sequía	McClaran & Sundt (1992)
Spiranthes	parksii	Si		-	-	-	-	Efecto abiótico: herbivoría	Wonka (2010)
Telipogon	helleri	Si	-	-	-	-	Si	Dinámica de transición	Raventós et al. (2018)
Tolumnia	variegata	Si	Si	Si	-	-	Si	El costo de reproducción	Calvo (1993)
Trichocentrum	undulatum	-	-	-	-	-		Efecto de aislamiento	Borrero et al. (2023)

*Trichocentrum undulatum*. Foto: Hong Liu

Notas para añadir a la tabla

IPM - Integrated Population Model
Transient dynamics
Transfer function

Especies de orquídeas estudiadas sin MPP

En la siguiente lista incluimos algunos de los trabajos de dinámica poblacional que no usan MPP para responder a su pregunta. La lista es muy grande y no es exhaustiva. Incluye trabajos que usan otros métodos de estimación de parámetros, como modelos de regresión, o que usan IPM (Integral Population Models), pero no usan matrices de transición de estados o edades, que es el método alterno de estimación de parámetros que se usa en este libro.

*Spiranthes delitescens*. Foto: Mitchel McClaran

Género	Especies	Otro	Referencia
Isotria	medeoloides	no matrix	Alahuhta et al. (2017)
Cyclopogon	luteoalbus	no matrix	Juárez, Montaña & Franco (2014)
Cypripedium	calceolus	no matrix	Davison et al. (2013)
Cypripedium	candidum	no matrix	Shefferson, Mizuta & Hutchings (2017)
Gymnadenia	conopsea	no matrix	Øien & Moen (2002)
Ophrys	sphegodes	no matrix	Hutchings (2010)
Ophrys	sphegodes	no matrix	Shefferson, Mizuta & Hutchings (2017)
Orchis	morio	no matrix	Wells et al. (1998)
Spiranthes	spiralis	no matrix	Jacquemyn et al. (2007)

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