Índice de figuras y tablas

Listado de todas las figuras y tablas del libro, organizadas por capítulo y orden de aparición. La numeración es relativa a cada capítulo. Clic en el enlace del capítulo para navegar a su contenido.

Total: 147 figuras y 6 tablas con caption explícito en 20 capítulos.

Las tablas markdown simples sin caption (e.g., listas de referencias, comparaciones tabulares cortas) no se incluyen en este índice. Las figuras generadas dinámicamente por código R que no tienen fig-cap explícito tampoco aparecen — se las puede ubicar en el manifiesto de figuras para el productor (Figuras_Manifiesto.md).

Figuras

Introducción

  • Fig. 1 — Cambio poblacional en tiempo
  • Fig. 2 — Tolumnia variegata. Foto: Tremblay
  • Fig. 3 — Factores que influyen en la dinámica de una población

Ciclos de Vida

  • Fig. 1 — Diagrama del ciclo de vida con matriz de proyección de tres estadios (semillas, plántulas, adultos)…
  • Fig. 2 — Diagrama del ciclo de vida con matriz de proyección de cuatro estadios (semillas, plántulas,…
  • Fig. 3 — Diagrama del ciclo de vida con matriz de proyección de cinco estadios (semillas, plántulas y tres…
  • Fig. 4 — Diagrama del ciclo de vida con matriz de proyección de tres estadios (inmaduros, reproductivos…
  • Fig. 5 — Diagrama del ciclo de vida con matriz de proyección de cuatro estadios incluyendo latencia para…
  • Fig. 6 — Diagrama del ciclo de vida con matriz de proyección de cuatro estadios incluyendo latencia de dos…
  • Fig. 7 — Orchis purpurea. Foto: Hans Jacquemyn
  • Fig. 8 — Diagrama del ciclo de vida con matriz de proyección de seis estadios (protocormos, tubérculos,…
  • Fig. 9 — Orchis purpurea. Foto: Hans Jacquemyn
  • Fig. 10 — Ejemplo de un ciclo de vida incompleto con tres errores típicos durante la recolección de datos:…
  • Fig. 11 — Ciclo de vida generado con Rage::plotlifecycle a partir de la matriz matA con los estadios…
  • Fig. 12 — Diagrama de ciclo de vida construido con el paquete Rage.

Recopilación de datos en el campo

  • Fig. 1 — Crecimiento epífito de Laelia autumnalis sobre las ramas y tronco de un encino. Foto: Aucencia…
  • Fig. 2 — Laelia autumnalis en su hábitat rupícola, crédito: Foto: Aucencia Emeterio-Lara
  • Fig. 3 — Trichocentrum undulatum. Foto: Hong Liu
  • Fig. 4 — Trichocentrum undulatum. Foto: Hong Liu
  • Fig. 5 — Lepanthes rupestris con inflorescencias seca y activa. Foto: Raymond L. Tremblay
  • Fig. 6 — Prosthechea karwinskii. Foto: Mariana Hernández-Apolinar
  • Fig. 7 — Cypripedium irapeanum. Foto: Claudia C. Gutiérrez-Paredes
  • Fig. 8 — Vanilla planifolia. Foto: Mark Blackman
  • Fig. 9 — Laelia speciosa. Foto: Leonel López-Toledo
  • Fig. 10 — Técnica de rapel usada para el muestreo de orquídeas rupícolas: Dendrobium. Foto: Hong Liu, 2020.
  • Fig. 11 — Muestreo de orquídeas epífitas con ascenso de una sola cuerda: Prosthechea karwinskii. Foto: Alonso…
  • Fig. 12 — Zonificación de árboles hospedero, basada en los modelos Catling (1986) y Johansson (1974). Dibujo…
  • Fig. 13 — Distribución tridimensional de Laelia speciosa sobre Quercus deserticola, basada en…
  • Fig. 14 — Distribución espacial de los árboles hospedero de Laelia speciosa. Los círculos dentro del área de…
  • Fig. 15 — Método de triangulación para el muestreo de orquídeas terrestres. Se ilustra la forma de determinar…
  • Fig. 16 — Plántula de Cypripedium irapeanum. Foto: Claudia Gutiérrez-Paredes
  • Fig. 17 — Lepanthes woodburyana. Foto: Edwin Guevara
  • Fig. 18 — Uso de etiquetas de aluminio en marcaje de Cypripedium acaule. Foto: Tremblay
  • Fig. 19 — Uso de etiquetas de aluminio en marcaje con cinchos de plástico en Laelia autumnalis. Foto por…
  • Fig. 20 — Marcaje de Laelia speciosa abrazando el tronco con alambre plastificado y etiquetas de dymo. Foto:…
  • Fig. 21 — Los individuos de Lepanthes eltoroensis fueron identificados con una etiqueta de plástico clavada…
  • Fig. 22 — Marcaje de Cypripedium irapeanum con cinta de dymo. Foto: Hernández-Apolinar
  • Fig. 23 — Marcaje de Cypripedium acaule con banderitas. Foto: Tremblay

Transiciones

  • Fig. 1 — Carga de paquetes y funciones auxiliares para la generación de figuras del capítulo.
  • Fig. 2 — Diagrama del ciclo de vida generado con grvizsave a partir de la matriz matC con seis estadios para…

Fecundidad

  • Fig. 1 — Carga de paquetes y funciones auxiliares para la generación de figuras del capítulo.
  • Fig. 2 — Diagrama del proceso de fecundidad en orquídeas, mostrando la cadena de filtros sucesivos:…
  • Fig. 3 — Relación entre la cantidad de hojas y la probabilidad de floración en Brassavola cucullata en las…
  • Fig. 4 — Ciclo de vida generado a partir de la matriz matAsem con los estadios plántula, juvenil y adulto.
  • Fig. 5 — Ciclo de vida generado a partir de la matriz matApl con fecundidad de 1.333 plántulas por adulto.
  • Fig. 6 — Ciclo de vida generado a partir de la matriz matApl2 con fecundidad de 0.5 plántulas por adulto.

Matrices U, F y C

  • Fig. 1 — Carga de paquetes y funciones auxiliares para la generación de figuras del capítulo.
  • Fig. 2 — Relación entre matrices; Diseño: Samuel Gascoigne
  • Fig. 3 — Ciclo de vida generado a partir de la matriz de supervivencia y crecimiento matU con los estadios…
  • Fig. 4 — Ciclo de vida generado a partir de la matriz de fecundidad matF con los estadios plántulas, adultos…
  • Fig. 5 — Ciclo de vida generado a partir de la matriz de clonación matC extraída de Cypripedium calceolus…
  • Fig. 6 — Ciclo de vida generado a partir de la matriz de clonación matC extraída de Aechmea nudicaulis con…

Acercamiento bayesiano

  • Fig. 1 — Carga de los paquetes necesarios (tidyverse, popbio, raretrans, DiagrammeR, Rage, flextable) y de…
  • Fig. 2 — Diagrama del ciclo de vida correspondiente a la matriz de proyección matA con sus estadios y…
  • Fig. 3 — Lepanthes eltoroensis. Foto: Edwin Guevara
  • Fig. 4 — Lepanthes eltoroensis. Foto: Edwin Guevara
  • Fig. 5 — Diagrama del ciclo de vida de la matriz de transiciones Tmat con los estadios plántulas, juveniles…
  • Fig. 6 — Probabilidades posteriores de transición por destino para dos pesos del prior (1 y 9),…
  • Fig. 7 — Histograma de la distribución posterior de la tasa finita de crecimiento λ obtenida a partir de…

Crecimiento poblacional

  • Fig. 1 — Carga de los paquetes popbio, readr, Rage, tidyverse y flextable, y de las funciones auxiliares…
  • Fig. 2 — Diagrama del ciclo de vida de la matriz de Laelia speciosa mat1.1 (población 1, año 1) con cuatro…
  • Fig. 3 — Diagrama del ciclo de vida de la matriz de Laelia speciosa mat1.2 (población 1, año 2) con cuatro…
  • Fig. 4 — Tamaño poblacional total en función del año, representado con puntos unidos por líneas, a partir de…
  • Fig. 5 — Proyección del vector de estadios en el tiempo a partir de mat1.1, representada con…

Propiedades de la matriz

  • Fig. 1 — Carga de los paquetes popdemo, popbio, ggplot2, dplyr, scales y Rage, y de las funciones auxiliares…
  • Fig. 2 — Diagrama del ciclo de vida de la matriz Lr1Noerg de L. rubripetala con cuatro estadios, junto con…
  • Fig. 3 — Diagrama del ciclo de vida de la matriz Lr1Irr con cuatro estadios, junto con la evaluación de su…
  • Fig. 4 — Proporción de la distribución estable de estadios por categoría (plántulas, juveniles, adultos no…
  • Fig. 5 — Spathoglottis plicata. Foto: Tremblay
  • Fig. 6 — Tamaño poblacional en función del tiempo para cuatro coeficientes de amortiguamiento (0.3, 1.0,…
  • Fig. 7 — Proporción de cada estadio en función del paso de tiempo, representada con líneas de color por…

Elasticidad y sensibilidad

  • Fig. 1 — Lepanthes eltoroensis. Foto: Tremblay
  • Fig. 2 — Lepanthes caritensis. Foto: Edwin Guevara
  • Fig. 3 — Lepanthes caritensis. Foto: Edwin Guevara
  • Fig. 4 — Diagrama de barras agrupadas de la elasticidad por proceso demográfico (fecundidad, estasis,…
  • Fig. 5 — Diagrama de barras agrupadas de la elasticidad por etapa de vida (plántulas, no reproductivos,…
  • Fig. 6 — Laelia speciosa. Foto: Eduardo A. Pérez García

Dinámica transitoria

  • Fig. 1 — Lepanthes rupestris. Foto: Tremblay
  • Fig. 2 — Proyección poblacional a 50 intervalos para el escenario 1 (límite inferior, vector inicial…
  • Fig. 3 — Proyección a 50 intervalos de la matriz Lr1 estandarizada por λ partiendo de la estructura estable…
  • Fig. 4 — Proyección poblacional a 50 intervalos para el escenario 5 (límite superior, vector inicial…
  • Fig. 5 — Curvas de densidad poblacional relativa en función del tiempo para los distintos escenarios de…
  • Fig. 6 — Panel de tres gráficas (layout 1×3) de la dinámica transitoria estandarizada en escala logarítmica…
  • Fig. 7 — Curvas de densidad poblacional relativa a λ máx en función del intervalo de proyección (meses) para…
  • Fig. 8 — Curvas de densidad poblacional relativa a λ máx por escenario (Límite inferior, Estable, Límite…
  • Fig. 9 — Curvas de la dinámica transitoria para cinco escenarios iniciales sobre la matriz Lr1, con…

Funciones de transferencia

  • Fig. 1 — Función de transferencia de λ frente a la perturbación p del elemento a₃₃ (permanencia de adultos…
  • Fig. 2 — Función de transferencia de λ frente a la perturbación p del elemento a₂₄ (transición de juveniles…
  • Fig. 3 — Función de transferencia de λ frente a la perturbación p del elemento a₃₄ (transición de adultos…
  • Fig. 4 — Función de transferencia de λ frente a la perturbación p del elemento a₁₄ (fecundidad de adultos…
  • Fig. 5 — Matriz de funciones de transferencia de λ para todos los elementos de Lr1 calculada con…
  • Fig. 6 — Función de transferencia de la inercia poblacional frente a la perturbación p del elemento a₃₃ de…
  • Fig. 7 — Matriz 4×4 de funciones de transferencia de la inercia poblacional para los elementos de Lr1…
  • Fig. 8 — Matriz de funciones de transferencia de la inercia poblacional para los elementos de Lr1 evaluada…
  • Fig. 9 — Matriz de funciones de transferencia de la inercia poblacional para los elementos de Lr1 evaluada…
  • Fig. 10 — Matriz de funciones de transferencia de la inercia poblacional para los elementos de Lr1 partiendo…
  • Fig. 11 — Diez paneles de funciones de transferencia tf1–tf10 compuestos con cowplot::plotgrid en una…

LTRE

  • Fig. 1 — Carga de paquetes (tidyverse, Rage, DiagrammeR, popbio, popdemo, latex2exp) y de los ayudantes de…
  • Fig. 2 — Cuadro 1. Matrices de proyección poblacional de Oncidium brachyandrum en dos hospederos (Quercus…
  • Fig. 3 — Diagrama dirigido del ciclo de vida con nodos por etapa y flechas coloreadas etiquetadas con las…
  • Fig. 4 — Diagrama dirigido del ciclo de vida de Oncidium brachyandrum localizados sobre Quercus rugosa. Los…
  • Fig. 5 — Barras de la contribución LTRE en función de la tasa vital, rellenadas por razón vital, con línea…
  • Fig. 6 — Barras del promedio de la sensitividad en función de la tasa vital, rellenadas por razón vital, con…
  • Fig. 7 — Barras agrupadas (dodge) de la contribución a λ en función de las transiciones, coloreadas por…
  • Fig. 8 — Barras agrupadas (dodge) de la contribución a λ en función de las transiciones, coloreadas por…

Métodos de simulaciones

  • Fig. 1 — Serapias cordigera. Foto: Guiseppe Pelligrino
  • Fig. 2 — Serapias cordigera. Foto: Guiseppe Pelligrino
  • Fig. 3 — Histogramas (30 bins) del número de individuos simulados de Serapias cordigera, facetados por etapa…
  • Fig. 4 — Histograma (30 bins) del total de individuos por simulación de Serapias cordigera, sumado a través…
  • Fig. 5 — Histogramas superpuestos (30 bins) del total de individuos por simulación de Serapias cordigera…
  • Fig. 6 — Histogramas superpuestos (30 bins) del total de individuos por simulación de Serapias cordigera…
  • Fig. 7 — Serapias cordigera. Foto: Guiseppe Pelligrino
  • Fig. 8 — Puntos con barras de error (IC inferior y superior) de λ en función del tipo de variación para…
  • Fig. 9 — Cinco distribuciones beta (densidad en función de la probabilidad) para latentes, plántulas,…

Historia breve de MPP en orquídeas

  • Fig. 1 — Dactylorhiza praetermissa; de la publicación

Carl Olaf Tamm

  • Fig. 1 — Carga de paquetes (tidyverse, popbio, Rage, DiagrammeR, raretrans, entre otros) y definición del…
  • Fig. 2 — Dactylorhiza sambucina. Foto: James D. Ackerman
  • Fig. 3 — Dactylorhiza maculata con hormigas y spittle bugs. Foto: James D. Ackerman
  • Fig. 4 — Diagrama dirigido del ciclo de vida de Dactylorhiza con nodos Vegetativo, Florecido y Latente y…
  • Fig. 5 — Histograma (binwidth 0.01) de la distribución posterior de λ en Dacty0.1b, con línea vertical de…

Rage

  • Fig. 1 — Gráfico de barras (geombar) de la frecuencia de estudios según la cantidad de poblaciones…
  • Fig. 2 — Diagrama de rangos (geomlinerange con coordflip) que muestra el inicio y el fin de cada estudio por…
  • Fig. 3 — Histograma de la duración de los estudios en Orquideas con relleno por OrganismTypeRC y facetas por…
  • Fig. 4 — Histograma de los valores de lambda en ALLLambdas con relleno por HabitType y facetas por hábito de…
  • Fig. 5 — Gráfico stathalfeye de las distribuciones t de Student de los coeficientes del modelo…
  • Fig. 6 — Distribuciones predichas (stathalfeye) de lambda según HabitType a partir del modelo modellambda,…
  • Fig. 7 — Mapa mundial con borders() y geompoint que ubica las poblaciones de LatLong en coordenadas Lon y…
  • Fig. 8 — Diagrama de cajas con puntos superpuestos (geomboxplot más geomjitter) del tiempo generacional en…

Protocolo estándar

  • Fig. 1 — Bloque de configuración que carga los paquetes Rage, DiagrammeR y tibble junto con las funciones…
  • Fig. 2 — FIGURA 1: Resultados de la encuesta a expertos en ecología de poblaciones que participaron (n =…
  • Fig. 3 — FIGURA2: Tanto los artículos sobre MPP de plantas como de animales muestran patrones similares en…
  • Fig. 4 — FIGURA 3: En los artículos sobre MPP de plantas y animales, la mayoría de las publicaciones no…
  • Fig. 5 — Diagrama de ciclo de vida de tres estadios construido manualmente con DiagrammeR/grvizsave a partir…
  • Fig. 6 — FIGURA 4: La descomposición de un MPP en sus submatrices permite aislar tasas vitales que de otro…

Datos sin sentido biológico

  • Fig. 1 — Bloque de configuración que instala y carga los paquetes DiagrammeR, Rage, popdemo, popbio,…
  • Fig. 2 — Ciclo de vida correspondiente a la matriz Sp1matA con estadios plántula, juvenil y adulto, sin…
  • Fig. 3 — Erycina crista-galli. Foto: Diana Molina Ozuma
  • Fig. 4 — Ciclo de vida correspondiente a la matriz Sp1matANT con estadios plántula, juvenil y adulto, sin…
  • Fig. 5 — Ciclo de vida correspondiente a la matriz Sp1matUNS con estadios plántula, juvenil y adulto, sin…
  • Fig. 6 — Ciclo de vida correspondiente a la matriz SerapiaA con estadios latente, plántulas, vegetativa y…
  • Fig. 7 — Gráfico de la proyección poblacional (project con vector n y time 5) de la matriz Sp1matAFert con…
  • Fig. 8 — Ciclo de vida correspondiente a la matriz Sp1matAFert2 con estadios semillas, plántula, juvenil y…
  • Fig. 9 — Ciclo de vida correspondiente a la matriz Dirichlet con estadios plántula, juvenil y adulto, sin…
  • Fig. 10 — Gráficas de densidad (geomdensity) con facetas por estadio que muestran la distribución de las…
  • Fig. 11 — Gráficas de densidad (geomdensity) con facetas por estadio (Plántulas, Juvenil, Adulto, Muerto) de…

Apéndice A: Lista de especies

  • Fig. 1 — Trichocentrum undulatum. Foto: Hong Liu
  • Fig. 2 — Spiranthes delitescens. Foto: Mitchel McClaran

Tablas

Recopilación de datos en el campo

  • Tabla 1 — Zonificación de árbol hospedero.
  • Tabla 2 — Orquídea predominante por zona.
  • Tabla 3 — Variables esenciales en un censo demográfico.

Elasticidad y sensibilidad

  • Tabla 1 — Matriz de elasticidad de Erycina crista-galli. Los colores de las entradas de la matriz representan…
  • Tabla 2 — Valores de elasticidad por proceso y por estadios no reproductivos y reproductivos de cinco…

LTRE

  • Tabla 1 — Matrices de proyección poblaciones de dos poblaciones de Oncidiun brachyandrum creciendo sobre…